Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
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Ggta1P23336 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ggta1P23336 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms