Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm7879-202ENSMUST00000200338 635 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 4933432K03Rik-201ENSMUST00000205739 1247 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm4120-201ENSMUST00000220456 578 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
P10404 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
P10404 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
P10404 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
P10404 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
P10404 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
P10404 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
P10404 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
P10404 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
P10404 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
P10404 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
P10404 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
P10404 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
P10404 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
P10404 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
P10404 Gm6807-201ENSMUST00000077435 888 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms