Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
TtrP07309 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
TtrP07309 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
TtrP07309 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
TtrP07309 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
TtrP07309 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
TtrP07309 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
TtrP07309 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
TtrP07309 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
TtrP07309 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TtrP07309 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TtrP07309 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TtrP07309 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms