Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
H2-Eb1P04230 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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H2-Eb1P04230 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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H2-Eb1P04230 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
H2-Eb1P04230 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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