Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm43809-201ENSMUST00000200694 338 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Ighv1-67-201ENSMUST00000103538 294 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Gm20795J3QP49 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms