Protein–RNA interactions for Protein: J3QME2

Gm20914, Predicted gene, 20914, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20914J3QME2 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Gm20914J3QME2 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Gm20914J3QME2 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms