Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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H2-M1F7CXU4 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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H2-M1F7CXU4 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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H2-M1F7CXU4 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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H2-M1F7CXU4 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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H2-M1F7CXU4 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-M1F7CXU4 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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