Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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