Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Scn3aA2ASI5 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms