Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rnf4Q9QZS2 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms