Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 4933427I22Rik-202ENSMUST00000153921 1378 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm20492-201ENSMUST00000172591 286 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm5977-201ENSMUST00000174304 573 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Igkv4-62-201ENSMUST00000177795 288 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Aldoart1-202ENSMUST00000179234 2050 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm21976-202ENSMUST00000180066 831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 1110019D14Rik-202ENSMUST00000181225 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Calm5-201ENSMUST00000183198 589 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm28453-202ENSMUST00000185975 1337 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm31373-201ENSMUST00000194403 737 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm42538-202ENSMUST00000199431 358 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm44257-201ENSMUST00000204469 1446 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm33180-201ENSMUST00000217109 1480 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 AC124436.1-201ENSMUST00000217917 342 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm7476-201ENSMUST00000220112 661 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm46992-201ENSMUST00000222120 1389 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 AC102000.1-201ENSMUST00000226247 727 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Sftpc-201ENSMUST00000022692 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Trpd52l3-201ENSMUST00000025727 2231 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Tmem14a-201ENSMUST00000027064 1261 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Fshb-201ENSMUST00000028533 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Afp-201ENSMUST00000042755 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm11567-201ENSMUST00000078442 1043 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Mir212-201ENSMUST00000083656 91 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm5499-201ENSMUST00000090731 885 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Pcnp-201ENSMUST00000096021 608 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Lpin1-202ENSMUST00000111067 5433 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 9430073C21Rik-201ENSMUST00000145346 2173 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Slc30a6-201ENSMUST00000024870 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm36251-201ENSMUST00000213712 1914 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Smco3-203ENSMUST00000203468 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Pdzrn4-201ENSMUST00000035399 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Pgpep1Q9ESW8 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms