Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnf6Q9DBU5 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms