Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rhobtb3Q9CTN4 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rhobtb3Q9CTN4 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms