Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FarsaQ8C0C7 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms