Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Dsg1bQ7TSF1 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Dsg1bQ7TSF1 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Dsg1bQ7TSF1 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Dsg1bQ7TSF1 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Dsg1bQ7TSF1 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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Dsg1bQ7TSF1 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Dsg1bQ7TSF1 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Dsg1bQ7TSF1 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Dsg1bQ7TSF1 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Dsg1bQ7TSF1 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Dsg1bQ7TSF1 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Dsg1bQ7TSF1 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Dsg1bQ7TSF1 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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