Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms