Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Sema5a-201ENSMUST00000067458 10809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Specc1-207ENSMUST00000201364 4955 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Satb1-213ENSMUST00000169480 6194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Kansl1-203ENSMUST00000106971 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Med13l-202ENSMUST00000201010 7781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms