Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm28677-202ENSMUST00000186904 615 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm45795-201ENSMUST00000211847 400 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1255-201ENSMUST00000057369 933 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Ube2e2-201ENSMUST00000076133 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr353-201ENSMUST00000100149 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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