Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Klhdc9Q3USL1 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Klhdc9Q3USL1 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Klhdc9Q3USL1 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Klhdc9Q3USL1 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Zzz3-203ENSMUST00000106101 7539 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Klhdc9Q3USL1 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms