Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Snx27Q3UHD6 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Snx27Q3UHD6 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Snx27Q3UHD6 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Snx27Q3UHD6 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms