Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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