Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms