Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

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Length 1,482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Klhl32-203ENSMUST00000108214 5970 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Wdr11-201ENSMUST00000084519 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 CT025642.2-201ENSMUST00000225009 1649 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Grin2bQ01097 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Grin2bQ01097 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Grin2bQ01097 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Grin2bQ01097 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Grin2bQ01097 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Grin2bQ01097 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Grin2bQ01097 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Grin2bQ01097 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.8 ms