Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Rps29P62274 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms