Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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Cldn18P56857 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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