Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Sh3bp1P55194 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Sh3bp1P55194 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Sh3bp1P55194 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Sh3bp1P55194 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Sh3bp1P55194 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sh3bp1P55194 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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