Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp4P35123 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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