Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxc11P31313 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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