Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Hoxd10P28359 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Hoxd10P28359 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Hoxd10P28359 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Hoxd10P28359 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Hoxd10P28359 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Hoxd10P28359 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Hoxd10P28359 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Hoxd10P28359 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hoxd10P28359 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hoxd10P28359 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hoxd10P28359 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hoxd10P28359 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hoxd10P28359 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
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Hoxd10P28359 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd10P28359 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd10P28359 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Hoxd10P28359 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Hoxd10P28359 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms