Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm17995-201ENSMUST00000209266 530 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ptpn3-201ENSMUST00000075637 6369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Synj2-201ENSMUST00000061091 4072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Zfp979-202ENSMUST00000105720 2594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd9P28357 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms