Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Pes1-202ENSMUST00000109985 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Pes1-201ENSMUST00000020705 2911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prim1P20664 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Slc1a7-201ENSMUST00000106713 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Mat1a-203ENSMUST00000225720 3468 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm12183-201ENSMUST00000120566 1848 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Inpp5d-210ENSMUST00000169754 4937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Tmem144-201ENSMUST00000029568 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 2600014E21Rik-201ENSMUST00000186411 4805 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Prkd3-202ENSMUST00000118768 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm44764-202ENSMUST00000204912 671 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Zfp474-202ENSMUST00000209270 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC125543.2-201ENSMUST00000222114 105 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 CT030170.7-201ENSMUST00000223372 103 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Cd8a-201ENSMUST00000066747 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm45903-201ENSMUST00000212891 2898 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm17076-201ENSMUST00000165185 1401 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Mcf2l-208ENSMUST00000110879 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Tex21-201ENSMUST00000021453 2137 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm15496-201ENSMUST00000129578 2456 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Gm28370-201ENSMUST00000185303 3375 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prim1P20664 Med12-202ENSMUST00000087956 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms