Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RhoP15409 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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RhoP15409 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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RhoP15409 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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RhoP15409 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RhoP15409 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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