Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
P10404 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
P10404 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms