Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm15401-201ENSMUST00000081929 1107 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccl20O89093 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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