Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms