Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm12133-201ENSMUST00000121775 661 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm15729-201ENSMUST00000125829 360 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Tnni1-208ENSMUST00000154463 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Halr1-202ENSMUST00000155758 408 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm20548-205ENSMUST00000174864 787 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm4929-201ENSMUST00000182021 992 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm20844-201ENSMUST00000186101 654 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm21832-201ENSMUST00000186439 691 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm45674-201ENSMUST00000210043 450 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Calb2-202ENSMUST00000212297 1080 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 AC137127.2-201ENSMUST00000215086 935 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 CT485606.2-201ENSMUST00000216728 401 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gpx4-ps2-202ENSMUST00000217344 782 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm18119-201ENSMUST00000219972 616 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 CT030646.1-201ENSMUST00000225049 980 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 CT009556.2-201ENSMUST00000227980 1123 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 2410137M14Rik-201ENSMUST00000039846 865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Hspb3-201ENSMUST00000054650 781 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Olfr1120-201ENSMUST00000058737 1018 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Iqcf5-201ENSMUST00000085113 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Pcnp-201ENSMUST00000096021 608 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Olfr550-201ENSMUST00000098225 1038 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Gm20538F6Z9R1 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms