Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Spocd1B1ASB6 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms