Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm23946-201ENSMUST00000104423 197 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm7162-201ENSMUST00000161205 1024 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rabgef1Q9JM13 Gm7879-202ENSMUST00000200338 635 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms