Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Tlr5Q9JLF7 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Tlr5Q9JLF7 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Tlr5Q9JLF7 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms