Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ush1cQ9ES64 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ush1cQ9ES64 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ush1cQ9ES64 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ush1cQ9ES64 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ush1cQ9ES64 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ush1cQ9ES64 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ush1cQ9ES64 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ush1cQ9ES64 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Ush1cQ9ES64 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ush1cQ9ES64 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ush1cQ9ES64 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ush1cQ9ES64 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ush1cQ9ES64 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ush1cQ9ES64 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ush1cQ9ES64 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ush1cQ9ES64 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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