Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Mrpl17Q9D8P4 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Mrpl17Q9D8P4 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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Mrpl17Q9D8P4 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Mrpl17Q9D8P4 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Mrpl17Q9D8P4 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Mrpl17Q9D8P4 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Mrpl17Q9D8P4 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Mrpl17Q9D8P4 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Mrpl17Q9D8P4 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Mrpl17Q9D8P4 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Mrpl17Q9D8P4 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Mrpl17Q9D8P4 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Mrpl17Q9D8P4 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms