Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn22Q9D7U6 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms