Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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