Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Prpf39Q8K2Z2 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Prpf39Q8K2Z2 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Prpf39Q8K2Z2 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Prpf39Q8K2Z2 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Prpf39Q8K2Z2 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Prpf39Q8K2Z2 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Prpf39Q8K2Z2 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Prpf39Q8K2Z2 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Prpf39Q8K2Z2 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Prpf39Q8K2Z2 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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