Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Snx27Q3UHD6 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Snx27Q3UHD6 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Snx27Q3UHD6 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Snx27Q3UHD6 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Snx27Q3UHD6 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Snx27Q3UHD6 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Snx27Q3UHD6 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Snx27Q3UHD6 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Snx27Q3UHD6 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Snx27Q3UHD6 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Snx27Q3UHD6 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Snx27Q3UHD6 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Snx27Q3UHD6 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx27Q3UHD6 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms