Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 351.1 ms