Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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