Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
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