Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Siah1bQ06985 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms