Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Mc1rQ01727 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms